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关键词:新型冠状病毒;大数据分析;Hanson解读
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)导致了肆虐全球的2019冠状病毒病(COVID-19),全球已经确诊超过826万例,病死超过44万人。
(来源:www.arcgis.com;截图:Hanson)我们曾在5月6日发过新冠病毒研究论文解读(新冠病毒),通过大数据分析总结了的在此方面的研究概况。
仅仅6周时间,COVID-19已经彻底改变了这个世界;而最近6天,北京重新出现病例,新增137例。有必要重新审视目前的研究情况,以对疫情防控提供参考。COVID-19 or SARS-COV-2 OR 2019-nCoV or "novel coronavirus"。截止到6月17日,全球已有23,592篇SCI论文发表,较6周前的9,736增长了142%。其中纳入到本次分析的是最新发表的10,000篇论文。第一部分是big analysis(大数据分析),也就是对发表论文的宏观分析,包括发表年度、国家/地区、杂志、作者、关联领域、最常发表的杂志等等。
第二部分是citation network(引用分析),是已经发表论文的被引用情况。我们都知道,论文的价值体现在被阅读和借鉴,并通过被引用次数体现出来。被引用越多的论文被认为是越有价值的论文,也就是经典论文。第三部分是美国国立卫生研究院立项初检结果。NIH除了有最庞大的科研院所之外,还负责管理生物医学领域的科研立项。
时间分布显示,针对新冠病毒(病)的研究更受关注,增长值已经达到最高的100。国家分布可以看到,中国近期发表的研究论文绝对数量较美国差距增大,但数量上仍居第二位。无法知道是否受“发表的新冠病毒论文需审核”的政策影响。
截止到6月17日,论文发表总数排名第一的仍然是华中科技大学(中国),第二则成为多伦多大学(加拿大),第三是牛津大学(英国),第四位是哈佛大学医学院(美国)。
可以看到,ACE2, TMPRSS2, NHS, BAD等是该研究领域最受关注的基因;而癌症、精神卫生、糖尿病、预防、肝脏、中风则是新发表论文最关注的领域,显示研究仍集中在病毒感染的预防和并发症的治疗上。
可以看到,与5月6日论文主要发表在顶级杂志BMJ、Lancet和NEJM等相比,新发表论文的最大变化是,medRxiv和bioRxiv两个预印版网站成为论文率先出现的主力,而J Med Virol继续在低分杂志中发表了最多的论文,同时Dermatol Ther和Med Hypotheses、Psychol Trauma等杂志成为发表论文的主力杂志。总体上,由于COVID-19研究的创新红利正在消退,接受论文的杂志需要降级。参考这个排名,对于投稿有非常强的参考价值。
上面仅显示影响力(论文总影响因子)最大的几位教授。需要注意的是,列表中没有列出详细机构的作者中,绝大部分是杂志社编辑。而之前曹彬教授列论著作者中第一名,目前已经被其他作者替代。而新排名中位居前列的作者也需要注意筛检。因为目前论著作者排前两名的Mehra, Mandeep R和Patel, Amit N发表的论文都已经被撤稿。他们发表的就是那篇引发地震的羟氯喹治疗COVID-19的论文(【纠错】)。真正排名第一的是Gostin, Lawrence O,其发表的论文都是从公共卫生角度做的研究。
其次是Vaduganathan, Muthiah,其研究领域主要是COVID-19对心血管的影响及用药。第三是Cohen, Myrons,其研究领域是治疗,包括单克隆抗体和羟氯喹。
根据这个大数据分析,短时间即可对COVID-19的研究热点和领域专家有了系统的了解,收获很大。
可以看到,5月6日最大的圈(被引用最多的论文)是Huang发表的关于COVID-19临床特点的论文。而到6月17日,影响力排名第一的论文已经是王辰院士/曹彬教授发表的瑞德西韦治疗重症COVID-19的论文。显示了对COVID-19的关注重点已经由早期的临床表现转移到后期的治疗。需要注意的是,王辰院士/曹彬教授发表的这篇论文,能够因为引用次数而排到第一,可能与对这项研究结果有争议、且NEJM连发三篇文章总结其经验教训有关(三国五位学者重新审视)。
(6月17日,引用最多的论文)
(6月17日,引用最多的论文)
正如我们上次推文中提到“尽管我们很高兴中国学者取得的成就,但也不能沾沾自喜,而是需要知道:论文影响力还取决于时间。中国学者发表的论文更早,所以被引用的几率也就更高。”从新的论文影响力可以看出,除了王辰院士/曹彬教授的论文,其他居于前列的重要论文中已经不再有华裔的名字。了解了COVID-19大牛、研究机构,也知晓了领域内的经典论文、及这些论文发表的杂志,顿时感觉“腹有诗书气自华”,腰板挺直了很多。但是,这些只是存量知识。而未来需要创造。知识的实时更新,及时获得最新研究进展非常重要。
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总结:
通过大数据分析,获取了COVID-19领域的研究热点领域和基因、研究机构和知名专家,这些研究发表的杂志,以及该领域的经典论文和美国NIH资助课题情况。
不仅有助于快速系统了解该领域,对于课题选题及课题设计、选取合适的投稿杂志都提供了非常有价值的参考。
简单总结一下新型冠状病毒(病)的文献及研究者总结:- 研究论文发表由最初的顶级杂志的比例非常高,变为普通杂志的比例更高;
- 中国学者仍是研究主力,发表的SCI论文数量仅次于美国; 医学科学家的成果也随着疫情而转移;
- 目前最有影响力的论文,已经由原来全部华人完成、到只剩下一篇有争议的研究论文;这是正常的变化,但也反映出中国仍缺乏能够一锤定音的研究。
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